Qualcosa di tremendo si nasconde all'interno dell'Alveare, vasto laboratorio sotterraneo gestito dall'Umbrella Corporation. Qualcuno ha introdotto al suo interno un virus micidiale che ha indotto la Regina Rossa, supercomputer che controlla l'Alveare, a sigillare l'intera struttura. Al suo interno rimangono così intrappolati tecnici e ricercatori che si sono trasformati in zombi. Ad Alice e a Rain è affidato il compito di isolare il virus prima che arrivi a minacciare la Terra.
