Il piano segreto della Seele prende corpo, e il quartiere generale Nerv finisce sotto attacco. Mentre i dipendenti Nerv cercano inutilmente di difendersi e divengono vittime di un vero e proprio massacro, Gendo prende con sé Rei e decide di avviare l'unione fra Adam e Lilith, ma viene fermato prima da Ritsuko (che paga con la vita il suo tentativo) e poi da Rei stessa. Nel frattempo Misato salva Shinji dall'attacco dei militari, e spedisce Asuka a battersi contro la Serie Eva lanciata dalla Seele, sia Misato che Asuka non sopravviveranno alle rispettive missioni. Shinji, sconvolto dalla fine di Misato e Asuka, nonché dall'apparizione della gigantesca Lilith, che racchiude in sé l'essenza di sua madre e di Rei Ayanami, lascia che l'Unità Evangelion 01 divenga lo strumento designato dalla Seele per avviare il Third Impact e portare a compimento il Progetto per il Perfezionamento dell'Uomo. Tutti gli AT Field del pianeta cedono, e ogni essere vivente torna allo stadio primordiale di LCL. Lo spirito di Shinji si confronta con quelli di Rei, Kaworu e Yui, lasciando uno spiraglio di speranza all'eventualità che gli esseri viventi possano ricreare le proprie identità singole.... ...fonte trama Neon Genesis Evangelion - The End of Evangelio streaming