Nel 1973, Gamera sacrifica la sua vita per liberare il mondo dai Gyaos una volta per tutte. Trentatré anni dopo, un bambino di nome Toru, il cui padre ha assistito all'evento del 1973, trova un uovo misterioso. Da esso, esce una piccola tartaruga. Toru ei suoi amici allevano la tartaruga, che si rivela essere una piccola Gamera. Dopo che una nuova creatura mangia-uomini di nome Zedus si è presentata in Giappone, tocca al piccolo Gamera salvare il mondo come il precedente Gamera aveva fatto prima....
